Без правильной организации информации невозможно построение эффективно действующей ГИС. Хорошо подготовленная цифровая карта является основой любой ГИС, но и смысловая, атрибутивная информация играет важную роль в системах прикладного назначения. В ряде случаев она даже важнее картографической составляющей, например, в кадастровых системах.
Большинство современных программ, как ГИС, так и системы управления базами данных (СУБД), предоставляют интуитивно понятные, легкие в освоении инструменты для манипулирования данными. Однако для разработки информационной системы, содержащей две-три взаимосвязанных таблицы, уже требуется знание основ организации автоматизированного хранения информации.